Если ставишь галку "пропускать движения мыши", то пропускаются и нажатия тоже. Некоторые теряются
(Добавление)
а если убираешь галку - все нажатия восстанавливаются

Ерунда. Тестируйте на калькуляторе, и меня не интересует - интересует ли вас это или нет.
Предугадываю что игра или программа в которой вы пытаетесь проводить эмуляцию требует именно предварительного наведения мыши на место где будет производиться клик или быстрее всего не готова к отработке ускоренного клика (с пропуском движения).

хм. 2 разных компа
регулярно перезагружаю, других программ в фоне нет. с чего бы тормозить непонятно...
Core2 duo 2 GHz
и Pentium G630 2.7 GHz
оба двухпроцессорные
Мышь USB. может из-за драйвера мыши?

и мне не понятно. Обычно для успешного решения вопросов я задаю четкие вопросы и получаю четкие ответы. В случае необходимости могу предложить дать удаленный доступ. Обычно все проблемы таким способом решаются.
В данном случае я вижу вы знаете лучше меня работу программ и их устройство, при этом полностью игнорируя справку и описание программ.
У меня пк такого плана. на нем снято видео по крафту в рф. Боюсь даже предложить (надо почитать описание а не эксперементировать), но Для синхронизации использовались контрольные точки по цвету в нужных местах.

Полагаюсь на интуитивно понятый дружественный интерфейс.

К сожалению более интуитивно у меня сделать не получилось...

Ладно... Постараюсь объяснить что к чему...
Дело в том что несмотря на вроде бы простоту поставленной перед этой программой задачи ее отличает некоторая сложность внутреннего устройства по сравнению с аналогами.
Если другие подобные кликеры заточены на простую задачу записи и воспроизведения, то в АвтоК решаются дополнительные задачи...
К примеру во время записи узнаются параметры не только положения мыши состояние клавиатуры, но так же записываются цвета пикселей и параметры окон с которыми работает программа. В реальном времени отслеживаются все эти изменения. Все это более затратно к ресурсам компьютеров, чем простая запись манипуляций с мышей и клавой.
Все это делается для "Умной" синхронизации воспроизведения с записью.
Что это означает...
При воспроизведение записи все окна программ устанавливаются в позиции и размеры как были при записи, независимо от того как были сдвинуты или масштабированны пользователем в процессе работы на компьютере.
Во время воспроизведения в онлайн играх многое зависит от времени ответа от сервера. Бывают продолжительные непредвиденные задержки. Простой алгоритм работы записи автокликера будет тупо, как вы сказали "как попугай", повторять запись. Что из этого получится?
АвтоК анализирует экран и приостановит воспроизведение в таком случае, продолжив его после достижения условий что было при записи. Опять же читаем описание, смотрим видео крафта и учимся.
Короче АвтоК это не попугай. Тут надо знать что и как использовать и будет вам счастье.
Хотя может добавлю опцию попугайной записи...

Нашел я где грабли!
Если ставишь галку "клавиатура" - воспроизведение идет с тормозами
Исли снимаешь галку - воспроизводится один в один
Проверено на двух разных компах
Компы не тормознутые
(Добавление)
Причем с клавиатуры не идет никакая информация вообще.
ПРоверено на USB клаве и на ноуте, у которого встроенная клава (PS2)

Вот я чет не понял? Включается антиантикликер??

Воспроизведение начинает тормозиться если включить воспроизведение клавы тоже
(Добавление)
я не понял это баг при записи или при воспроизведении пока
(Добавление)
Вот сделал запись 60-секундную кликания мышкой по десктопу.
При воспроизведении эта запись воспроизводилась 75 секунд
(Добавление)
Это баг воспроизведения. Отключаю воспроизведение клавиатуры при выполнении этого же скрипта - воспроизводится ровно 60 секунд
(Добавление)
Клавиатура USB

Правила создания темы

Жду ответ на вопрос.
Если в дальнейшем я не буду получать всей нужной информации - тема будет удалена как бессмысленная и дезоинформирующая, поскольку мало того что не несет нужной информации для устранения проблемы, но и быстрее всего является следствием грубых ошибок использования программы в следствии игнорирования справки.
В дальнейшем случае помощь оказывать не буду.