Рисую в виз редакторе. Иногда появляются точки около квадратов в которые можно упереться переходом. Иногда эти точки попадают в другой квадрат. Влияет ли это попадание. на получение кода ? Неудобно, что надо их обходить когда рисуешь переходы. Эти точки удаляются только удалением квадратика. На рис. для примера, воткнул в пару точек переход. И так по всей схеме.
Всегда стоит галка "рабочих" (не умею ровно рисовать ) Да и в начале их не было.
Что сделать, чтобы не появлялись ?

Это видать от копирования блоков. не копируйте пока. Делайте без этого. Потом разберусь.

Да, появляются после копирования.

я об этом говорил уже давно, когда только копирование появилось. Из-за этой проблемы перестал использовать фичу.

Не было времени пофиксить. Займусь.

Исправил копирование. Теперь блоки копируются ровно и без разных квадратиков.