Загрузил скрипт на сервер с созданием exe. Включаю vpn и Кибор пишет, что скрипт не найден. Многие для игр используют vpn. Как быть?

Не использовать прокси для Кибор.
Или загружать скрипт до его включения.

На днях пропадал доступ к сайту и серверу в скрипте,хотел уточнить ни чего не поменялось в этом плане для работы с ВПН?

Нет. Честно даже не проверял что происходит через него.
Выходил с ситуации раздавая с телефона через вайфай мобильный интернет для запуска Кибор.
Ну это когда блокировало по iP домашний.